يعد لحرقة اللسان عدة أسباب أبرزها الحساسية تجاه المعادن مثل النيكل والكروم والزئبق في حشوات الأسنان مثلًا، وسوء التغذية مثل نقص الحديد أو فيتامين B9، أو فيتامين B12، أو فيتامين C.

وكشفت الرابطة الألمانية لأطباء الأنف والأذن والحنجرة، أن من الأسباب أيضًا العدوى الفطرية، أو الارتجاع المريئي، والتهابات الكبد، والداء البطني، والقناة الصفراوية، والتهاب القولون التقرحي، وداء السكري، والنقرس واضطرابات الغدة الدرقية.

وأشارت إلى أن الحرقة تنذر اللسان بالفيبروميالجيا الألم العضلي الليفي، أو أحد أمراض السرطان مثل داء هودجكن، وقد تكون أيضًا أثرًا جانبيًا لبعض الأدوية مثل أدوية ارتفاع ضغط الدم، والاكتئاب وأدوية العلاج الكيميائي للسرطان.