أحال النائب العام المصري 48 متهما بتفجيرات الكنائس للقضاء العسكري، لاتهامهم بتولى جماعة إرهابية وتأسيس خليتين بمحافظتى القاهرة وقنا، والانضمام إليها والمشاركة فيها، وارتكابهم وقائع تفجير الكنائس الثلاث «البطرسية بالعباسية والمرقسية بالاسكندرية ومارجرجس بالغربية» وقتل والشروع فى قتل مرتاديها وقوات تأمينها.

ووجهت النيابة العامة المصرية للمتهمين عدة تهم منها الهجوم على كمين النقب، وقتل عدد من القائمين عليه من قوات الشرطة، والشروع فى قتل الباقين، والاستيلاء على أسلحتهم وتصنيعهم وحيازتهم سترات وعبوات مفرقعة وأسلحة نارية وذخائر، والالتحاق بتنظيم داعش الإرهابى خارج البلاد، وتلقيهم تدريبات عسكرية بمعسكرات تابعة للتنظيم بدولتي ليبيا وسوريا.